Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO4P61968 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO4P61968 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO4P61968 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO4P61968 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO4P61968 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO4P61968 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LMO4P61968 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO4P61968 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO4P61968 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO4P61968 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO4P61968 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO4P61968 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO4P61968 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO4P61968 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO4P61968 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO4P61968 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO4P61968 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO4P61968 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO4P61968 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO4P61968 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO4P61968 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO4P61968 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO4P61968 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO4P61968 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO4P61968 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO4P61968 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO4P61968 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO4P61968 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO4P61968 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO4P61968 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO4P61968 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO4P61968 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO4P61968 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO4P61968 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMO4P61968 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms