Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NME5P56597 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NME5P56597 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
NME5P56597 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME5P56597 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME5P56597 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME5P56597 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME5P56597 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NME5P56597 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME5P56597 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME5P56597 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME5P56597 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NME5P56597 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NME5P56597 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NME5P56597 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NME5P56597 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NME5P56597 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME5P56597 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME5P56597 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME5P56597 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME5P56597 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME5P56597 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME5P56597 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME5P56597 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME5P56597 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME5P56597 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME5P56597 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NME5P56597 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms