Protein–RNA interactions for Protein: P56202

CTSW, Cathepsin W, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSWP56202 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTSWP56202 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTSWP56202 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTSWP56202 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTSWP56202 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTSWP56202 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTSWP56202 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTSWP56202 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTSWP56202 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTSWP56202 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CTSWP56202 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTSWP56202 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTSWP56202 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTSWP56202 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTSWP56202 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTSWP56202 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTSWP56202 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CTSWP56202 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTSWP56202 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTSWP56202 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTSWP56202 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTSWP56202 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTSWP56202 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTSWP56202 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTSWP56202 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTSWP56202 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CTSWP56202 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTSWP56202 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTSWP56202 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTSWP56202 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTSWP56202 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTSWP56202 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
CTSWP56202 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTSWP56202 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTSWP56202 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTSWP56202 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CTSWP56202 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CTSWP56202 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CTSWP56202 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTSWP56202 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTSWP56202 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTSWP56202 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTSWP56202 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTSWP56202 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTSWP56202 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTSWP56202 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTSWP56202 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTSWP56202 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTSWP56202 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTSWP56202 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTSWP56202 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTSWP56202 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTSWP56202 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTSWP56202 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CTSWP56202 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTSWP56202 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTSWP56202 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTSWP56202 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTSWP56202 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTSWP56202 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTSWP56202 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTSWP56202 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTSWP56202 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTSWP56202 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTSWP56202 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTSWP56202 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTSWP56202 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTSWP56202 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTSWP56202 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTSWP56202 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTSWP56202 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTSWP56202 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTSWP56202 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTSWP56202 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTSWP56202 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTSWP56202 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CTSWP56202 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTSWP56202 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTSWP56202 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTSWP56202 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTSWP56202 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms