Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AIF1P55008 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIF1P55008 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIF1P55008 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIF1P55008 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIF1P55008 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIF1P55008 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIF1P55008 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIF1P55008 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIF1P55008 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIF1P55008 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIF1P55008 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AIF1P55008 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AIF1P55008 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AIF1P55008 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AIF1P55008 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AIF1P55008 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AIF1P55008 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AIF1P55008 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AIF1P55008 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
AIF1P55008 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AIF1P55008 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AIF1P55008 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AIF1P55008 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AIF1P55008 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIF1P55008 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIF1P55008 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIF1P55008 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIF1P55008 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIF1P55008 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIF1P55008 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIF1P55008 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIF1P55008 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIF1P55008 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIF1P55008 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIF1P55008 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AIF1P55008 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AIF1P55008 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AIF1P55008 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AIF1P55008 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AIF1P55008 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
AIF1P55008 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AIF1P55008 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIF1P55008 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIF1P55008 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIF1P55008 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIF1P55008 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIF1P55008 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIF1P55008 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIF1P55008 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
AIF1P55008 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AIF1P55008 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AIF1P55008 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AIF1P55008 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AIF1P55008 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AIF1P55008 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AIF1P55008 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AIF1P55008 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
AIF1P55008 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AIF1P55008 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AIF1P55008 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
AIF1P55008 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms