Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RAD23AP54725 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RAD23AP54725 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
RAD23AP54725 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms