Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
RAB5CP51148 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
RAB5CP51148 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms