Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PSEN2P49810 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PSEN2P49810 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms