Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VEGFBP49765 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VEGFBP49765 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms