Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPIAP49247 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPIAP49247 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPIAP49247 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPIAP49247 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPIAP49247 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPIAP49247 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPIAP49247 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPIAP49247 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPIAP49247 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPIAP49247 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPIAP49247 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPIAP49247 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPIAP49247 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPIAP49247 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPIAP49247 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPIAP49247 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPIAP49247 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPIAP49247 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPIAP49247 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPIAP49247 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPIAP49247 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPIAP49247 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPIAP49247 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPIAP49247 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPIAP49247 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPIAP49247 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPIAP49247 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPIAP49247 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPIAP49247 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPIAP49247 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPIAP49247 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPIAP49247 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPIAP49247 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RPIAP49247 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPIAP49247 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPIAP49247 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPIAP49247 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPIAP49247 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPIAP49247 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPIAP49247 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPIAP49247 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPIAP49247 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPIAP49247 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPIAP49247 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPIAP49247 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPIAP49247 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPIAP49247 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPIAP49247 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPIAP49247 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPIAP49247 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPIAP49247 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPIAP49247 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPIAP49247 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPIAP49247 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPIAP49247 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPIAP49247 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RPIAP49247 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPIAP49247 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPIAP49247 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPIAP49247 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RPIAP49247 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPIAP49247 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms