Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGCXP38435 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGCXP38435 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGCXP38435 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GGCXP38435 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GGCXP38435 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GGCXP38435 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGCXP38435 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGCXP38435 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGCXP38435 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGCXP38435 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGCXP38435 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGCXP38435 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGCXP38435 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGCXP38435 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGCXP38435 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGCXP38435 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GGCXP38435 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GGCXP38435 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GGCXP38435 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GGCXP38435 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GGCXP38435 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGCXP38435 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GGCXP38435 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGCXP38435 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGCXP38435 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGCXP38435 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGCXP38435 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGCXP38435 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGCXP38435 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GGCXP38435 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GGCXP38435 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GGCXP38435 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GGCXP38435 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGCXP38435 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GGCXP38435 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGCXP38435 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGCXP38435 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGCXP38435 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GGCXP38435 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms