Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
POLR2IP36954 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
POLR2IP36954 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms