Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CYLC1P35663 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CYLC1P35663 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CYLC1P35663 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms