Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
COPB2P35606 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
COPB2P35606 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB2P35606 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB2P35606 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB2P35606 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB2P35606 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB2P35606 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB2P35606 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB2P35606 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB2P35606 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB2P35606 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
COPB2P35606 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB2P35606 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB2P35606 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB2P35606 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB2P35606 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB2P35606 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB2P35606 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
COPB2P35606 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB2P35606 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB2P35606 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB2P35606 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB2P35606 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB2P35606 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB2P35606 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB2P35606 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB2P35606 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB2P35606 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB2P35606 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
COPB2P35606 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB2P35606 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB2P35606 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB2P35606 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB2P35606 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB2P35606 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB2P35606 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB2P35606 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
COPB2P35606 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB2P35606 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB2P35606 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB2P35606 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB2P35606 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB2P35606 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB2P35606 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB2P35606 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB2P35606 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB2P35606 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB2P35606 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
COPB2P35606 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB2P35606 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB2P35606 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB2P35606 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB2P35606 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB2P35606 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB2P35606 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB2P35606 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB2P35606 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB2P35606 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
COPB2P35606 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB2P35606 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB2P35606 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB2P35606 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB2P35606 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB2P35606 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB2P35606 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB2P35606 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB2P35606 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
COPB2P35606 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPB2P35606 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPB2P35606 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPB2P35606 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
COPB2P35606 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
COPB2P35606 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB2P35606 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB2P35606 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB2P35606 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB2P35606 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB2P35606 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB2P35606 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB2P35606 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB2P35606 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB2P35606 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB2P35606 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
COPB2P35606 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
COPB2P35606 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms