Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CXCR5P32302 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CXCR5P32302 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CXCR5P32302 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms