Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLDCP23378 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GLDCP23378 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GLDCP23378 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GLDCP23378 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLDCP23378 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLDCP23378 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLDCP23378 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLDCP23378 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLDCP23378 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLDCP23378 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLDCP23378 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
GLDCP23378 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLDCP23378 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GLDCP23378 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLDCP23378 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLDCP23378 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLDCP23378 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLDCP23378 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLDCP23378 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLDCP23378 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLDCP23378 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLDCP23378 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLDCP23378 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLDCP23378 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GLDCP23378 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLDCP23378 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLDCP23378 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLDCP23378 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLDCP23378 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLDCP23378 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLDCP23378 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLDCP23378 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GLDCP23378 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GLDCP23378 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLDCP23378 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLDCP23378 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GLDCP23378 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLDCP23378 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLDCP23378 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLDCP23378 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLDCP23378 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLDCP23378 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GLDCP23378 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GLDCP23378 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GLDCP23378 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLDCP23378 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLDCP23378 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GLDCP23378 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLDCP23378 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLDCP23378 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GLDCP23378 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLDCP23378 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLDCP23378 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GLDCP23378 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLDCP23378 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLDCP23378 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLDCP23378 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLDCP23378 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLDCP23378 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GLDCP23378 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLDCP23378 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLDCP23378 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GLDCP23378 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLDCP23378 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GLDCP23378 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms