Protein–RNA interactions for Protein: P23258

TUBG1, Tubulin gamma-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBG1P23258 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TUBG1P23258 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBG1P23258 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms