Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TCEA1P23193 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TCEA1P23193 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms