Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
XPAP23025 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPAP23025 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XPAP23025 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPAP23025 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPAP23025 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPAP23025 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPAP23025 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPAP23025 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPAP23025 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
XPAP23025 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPAP23025 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
XPAP23025 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
XPAP23025 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XPAP23025 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPAP23025 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPAP23025 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPAP23025 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPAP23025 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XPAP23025 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPAP23025 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPAP23025 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPAP23025 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPAP23025 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPAP23025 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XPAP23025 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
XPAP23025 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XPAP23025 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPAP23025 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPAP23025 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPAP23025 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPAP23025 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPAP23025 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPAP23025 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XPAP23025 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XPAP23025 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPAP23025 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XPAP23025 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
XPAP23025 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPAP23025 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPAP23025 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPAP23025 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPAP23025 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XPAP23025 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XPAP23025 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms