Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRIM21P19474 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRIM21P19474 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms