Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ERCC2P18074 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ERCC2P18074 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ERCC2P18074 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms