Protein–RNA interactions for Protein: P17706

PTPN2, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 2, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN2P17706 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPN2P17706 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN2P17706 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms