Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DESP17661 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DESP17661 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DESP17661 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DESP17661 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DESP17661 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DESP17661 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DESP17661 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DESP17661 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DESP17661 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DESP17661 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DESP17661 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DESP17661 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DESP17661 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DESP17661 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DESP17661 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DESP17661 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DESP17661 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DESP17661 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DESP17661 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DESP17661 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DESP17661 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DESP17661 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DESP17661 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DESP17661 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DESP17661 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DESP17661 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DESP17661 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DESP17661 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DESP17661 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DESP17661 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DESP17661 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DESP17661 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DESP17661 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DESP17661 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DESP17661 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DESP17661 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DESP17661 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DESP17661 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DESP17661 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DESP17661 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DESP17661 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DESP17661 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DESP17661 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DESP17661 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DESP17661 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DESP17661 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DESP17661 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DESP17661 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DESP17661 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DESP17661 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DESP17661 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DESP17661 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DESP17661 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DESP17661 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DESP17661 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DESP17661 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DESP17661 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
DESP17661 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DESP17661 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DESP17661 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DESP17661 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DESP17661 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DESP17661 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DESP17661 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DESP17661 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
DESP17661 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
DESP17661 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DESP17661 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DESP17661 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DESP17661 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DESP17661 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
DESP17661 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms