Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC39.6■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC39.59■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC39.58■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC39.57■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC39.57■■■■□ 3.93
TOP2AP11388 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.56■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC39.54■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.53■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC39.52■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC39.51■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
TOP2AP11388 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC39.5■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC39.46■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC39.46■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
TOP2AP11388 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms