Protein–RNA interactions for Protein: P11216

PYGB, Glycogen phosphorylase, brain form, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGBP11216 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PYGBP11216 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYGBP11216 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYGBP11216 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYGBP11216 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYGBP11216 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYGBP11216 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYGBP11216 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PYGBP11216 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PYGBP11216 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGBP11216 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGBP11216 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGBP11216 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGBP11216 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGBP11216 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGBP11216 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGBP11216 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGBP11216 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGBP11216 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGBP11216 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PYGBP11216 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGBP11216 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGBP11216 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGBP11216 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGBP11216 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGBP11216 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGBP11216 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGBP11216 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGBP11216 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PYGBP11216 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PYGBP11216 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGBP11216 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGBP11216 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGBP11216 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGBP11216 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGBP11216 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGBP11216 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGBP11216 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PYGBP11216 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGBP11216 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGBP11216 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGBP11216 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGBP11216 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGBP11216 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGBP11216 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGBP11216 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PYGBP11216 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PYGBP11216 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.9 ms