Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
RGPD2P0DJD1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RGPD2P0DJD1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RGPD2P0DJD1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms