Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FAM58BPP0C7Q3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FAM58BPP0C7Q3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms