Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
HSP90AB1P08238 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSP90AB1P08238 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms