Protein–RNA interactions for Protein: O95803

NDST3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST3O95803 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST3O95803 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST3O95803 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST3O95803 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST3O95803 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NDST3O95803 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NDST3O95803 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST3O95803 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST3O95803 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST3O95803 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST3O95803 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST3O95803 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST3O95803 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDST3O95803 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDST3O95803 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDST3O95803 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST3O95803 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST3O95803 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST3O95803 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST3O95803 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST3O95803 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST3O95803 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST3O95803 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NDST3O95803 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST3O95803 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST3O95803 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST3O95803 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NDST3O95803 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST3O95803 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST3O95803 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST3O95803 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST3O95803 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST3O95803 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST3O95803 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST3O95803 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NDST3O95803 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NDST3O95803 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDST3O95803 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NDST3O95803 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NDST3O95803 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST3O95803 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST3O95803 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST3O95803 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST3O95803 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST3O95803 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST3O95803 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST3O95803 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NDST3O95803 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms