Protein–RNA interactions for Protein: O95521

PRAMEF1, PRAME family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF1O95521 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF1O95521 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF1O95521 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms