Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BBOX1O75936 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BBOX1O75936 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BBOX1O75936 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
BBOX1O75936 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
BBOX1O75936 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
BBOX1O75936 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
BBOX1O75936 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
BBOX1O75936 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
BBOX1O75936 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms