Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM3O75607 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM3O75607 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM3O75607 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM3O75607 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM3O75607 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM3O75607 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM3O75607 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NPM3O75607 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM3O75607 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM3O75607 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM3O75607 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM3O75607 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM3O75607 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM3O75607 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NPM3O75607 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM3O75607 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM3O75607 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM3O75607 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM3O75607 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM3O75607 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM3O75607 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM3O75607 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM3O75607 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM3O75607 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM3O75607 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NPM3O75607 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM3O75607 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM3O75607 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM3O75607 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM3O75607 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM3O75607 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM3O75607 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM3O75607 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM3O75607 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NPM3O75607 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM3O75607 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM3O75607 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM3O75607 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM3O75607 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM3O75607 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM3O75607 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM3O75607 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM3O75607 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NPM3O75607 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM3O75607 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM3O75607 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM3O75607 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM3O75607 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM3O75607 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NPM3O75607 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
NPM3O75607 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NPM3O75607 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
NPM3O75607 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM3O75607 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM3O75607 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM3O75607 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM3O75607 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM3O75607 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM3O75607 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM3O75607 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM3O75607 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NPM3O75607 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM3O75607 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM3O75607 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM3O75607 OR2J1-201ENST00000377171 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM3O75607 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM3O75607 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM3O75607 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM3O75607 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM3O75607 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM3O75607 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM3O75607 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM3O75607 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NPM3O75607 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NPM3O75607 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPM3O75607 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPM3O75607 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPM3O75607 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPM3O75607 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPM3O75607 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPM3O75607 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPM3O75607 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPM3O75607 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPM3O75607 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NPM3O75607 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms