Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GADD45BO75293 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GADD45BO75293 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms