Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
ABCC9O60706 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC45.12■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC45.11■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC45.11■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC45.08■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC45.07■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.81
ABCC9O60706 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC45.06■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC45.05■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC45.05■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.03■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.03■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.02■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC45.02■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC45.01■■■■■ 4.8
ABCC9O60706 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC45■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC44.99■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC44.98■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.98■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC44.97■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.97■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.97■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC44.97■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC44.96■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC44.96■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC44.96■■■■■ 4.79
ABCC9O60706 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC44.96■■■■■ 4.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms