Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRAK2O60296 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRAK2O60296 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms