Protein–RNA interactions for Protein: O43557

TNFSF14, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 14, humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF14O43557 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TNFSF14O43557 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TNFSF14O43557 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TNFSF14O43557 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms