Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKBKBO14920 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IKBKBO14920 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IKBKBO14920 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms