Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
I3L4J1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
I3L4J1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
I3L4J1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
I3L4J1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
I3L4J1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
I3L4J1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
I3L4J1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
I3L4J1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
I3L4J1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
I3L4J1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
I3L4J1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
I3L4J1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
I3L4J1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
I3L4J1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
I3L4J1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
I3L4J1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
I3L4J1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
I3L4J1 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
I3L4J1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
I3L4J1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
I3L4J1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
I3L4J1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
I3L4J1 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
I3L4J1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
I3L4J1 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
I3L4J1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
I3L4J1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
I3L4J1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
I3L4J1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
I3L4J1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
I3L4J1 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
I3L4J1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
I3L4J1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
I3L4J1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
I3L4J1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
I3L4J1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
I3L4J1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
I3L4J1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
I3L4J1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
I3L4J1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
I3L4J1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
I3L4J1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
I3L4J1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
I3L4J1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
I3L4J1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
I3L4J1 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
I3L4J1 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
I3L4J1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms