Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CBY3A6NI87 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CBY3A6NI87 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms