Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
USP17L3A6NCW0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
USP17L3A6NCW0 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms