Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MAP1LC3B2A6NCE7 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MAP1LC3B2A6NCE7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms