Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZNF197-204ENST00000383745 2935 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 TARS2-205ENST00000438568 2188 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 ARHGEF9-226ENST00000636392 1920 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 MEIS2-215ENST00000559561 1442 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 KLB-201ENST00000257408 6082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 EPHA1-201ENST00000275815 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 MAP4K2-201ENST00000294066 7178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 STAT3-202ENST00000389272 2615 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL035422.2-201ENST00000603059 565 ntBASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 RHOH-222ENST00000617441 1872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 MKL1-210ENST00000614754 3917 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 HOPX-202ENST00000337881 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 PCDHA11-202ENST00000616325 3418 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 CSTF2-201ENST00000372972 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 ENTPD3-204ENST00000456402 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 MCM2-201ENST00000265056 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 CSNK1G1-205ENST00000607537 2083 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AC106820.4-201ENST00000561847 5616 ntBASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 MADD-201ENST00000311027 5990 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
VPREB1P12018 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 CCDC3-202ENST00000378839 3180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 LINC00846-201ENST00000334165 1778 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 HDLBP-214ENST00000427183 6238 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 DHX38-201ENST00000268482 4608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 MXRA5Y-201ENST00000420610 8000 ntBASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 GOLGA8A-201ENST00000359187 1877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 CXorf21-201ENST00000378962 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 TBC1D14-208ENST00000451522 4149 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 MBOAT4-201ENST00000320542 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 DHRS7B-202ENST00000395511 2175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 MRPL44-201ENST00000258383 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 AL359649.1-201ENST00000607406 1741 ntBASIC8.81□□□□□ -1
VPREB1P12018 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms