Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 BSCL2-203ENST00000360796 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 OBP2A-203ENST00000371776 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CYCS-203ENST00000409764 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 RN7SL76P-201ENST00000482435 289 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC109466.1-201ENST00000517508 804 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MARVELD3-205ENST00000567501 582 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC008555.6-201ENST00000605047 458 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC007450.4-201ENST00000614709 524 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 RBP1-206ENST00000617459 667 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 LINC00923-208ENST00000621777 503 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 IKZF3-211ENST00000394189 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SLC37A3-203ENST00000447932 3254 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC116903.2-201ENST00000561674 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CDC42-202ENST00000344548 2256 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 OLFML1-204ENST00000530135 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CAV2-202ENST00000343213 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 GSTM1-204ENST00000369823 852 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 WDR54-202ENST00000409791 854 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 LINC02036-201ENST00000415869 910 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL078621.2-201ENST00000419351 698 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC074019.1-201ENST00000428788 1096 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ALKBH2-202ENST00000429722 1159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC253536.5-201ENST00000506097 347 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC007223.1-201ENST00000564076 572 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 RN7SL300P-201ENST00000582522 318 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 FXYD3-212ENST00000605550 590 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MAP3K14-205ENST00000617331 1049 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 GABARAPL1-219ENST00000629504 379 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ALLC-201ENST00000252505 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC023830.3-201ENST00000612995 1455 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 VOPP1-204ENST00000418904 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CD3G-202ENST00000392883 1179 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC007312.1-201ENST00000427493 258 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 JPT1-205ENST00000470924 663 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AL606834.1-201ENST00000553836 1169 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 MED11-203ENST00000575284 652 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 Z93930.2-203ENST00000585003 516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC087893.1-201ENST00000612818 664 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC073592.10-201ENST00000624789 597 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 AC016526.4-201ENST00000636059 517 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 SDR16C5-203ENST00000522671 1988 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SIRT1Q96EB6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
SIRT1Q96EB6 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms