Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 RXRG-201ENST00000359842 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CXorf40A-212ENST00000514208 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AL359649.1-202ENST00000375713 443 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AP005273.1-201ENST00000444862 522 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 EHMT2-202ENST00000375530 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 RPL29P2-201ENST00000488409 460 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 LINC00700-202ENST00000438372 777 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ALG1L15P-201ENST00000482834 794 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC023051.2-201ENST00000541141 460 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PIP4K2AP48426 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms