Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 DAB1-207ENST00000420954 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 POLD1-214ENST00000613923 3542 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 IFT172-202ENST00000359466 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CCDC12Q8WUD4 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms