Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PDXDC1-218ENST00000627450 2683 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CDK8P49336 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TNNT2-207ENST00000367322 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC091304.3-201ENST00000566500 716 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC211476.2-201ENST00000608799 708 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ALDOA-229ENST00000636698 420 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 ELMOD3-201ENST00000315658 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 APEX1-201ENST00000216714 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 DRD3-201ENST00000295881 1541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CDK8P49336 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK8P49336 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK8P49336 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK8P49336 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK8P49336 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK8P49336 SERPING1-202ENST00000340687 1719 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CDK8P49336 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 TONSL-AS1-201ENST00000442850 428 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 OR8J1-202ENST00000533152 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CDK8P49336 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms