Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZSCAN21-203ENST00000456748 1904 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZNF621-204ENST00000431278 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 LMO1-201ENST00000335790 1279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MTHFD2P7-201ENST00000483867 983 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SMUG1-221ENST00000514196 553 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 LMO1-204ENST00000534484 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TBCE-207ENST00000543662 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZNF568-206ENST00000455427 2378 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RC3H2-205ENST00000423239 3623 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMPOP42166 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ZNF573-204ENST00000392138 2266 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MRPL36-201ENST00000382647 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AC115284.2-201ENST00000624646 2054 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TUBB8P7-202ENST00000564451 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TMPOP42166 PTPN6-202ENST00000399448 2159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMPOP42166 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TMPOP42166 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 MLPH-202ENST00000338530 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 AC241585.2-201ENST00000578899 2307 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TMPOP42166 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.1 ms