Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 ARV1-201ENST00000310256 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 CUL2-210ENST00000626172 4115 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 MYO15B-236ENST00000633867 6323 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 IKZF1-211ENST00000440768 5511 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 LDB3-205ENST00000429277 5436 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 C3orf38-201ENST00000318887 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 IGHG1-202ENST00000390548 2619 ntAPPRIS P5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 PRR3-202ENST00000376560 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 KCNMA1-285ENST00000640605 3864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
FANCFQ9NPI8 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 SLC35A4-203ENST00000612662 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 WTIP-202ENST00000590071 13665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 FLNA-204ENST00000369856 8241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
FANCFQ9NPI8 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
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