Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 AL137779.3-201ENST00000553295 729 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 MAT2B-204ENST00000518095 3409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CANX-202ENST00000452673 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CFAP65-204ENST00000410037 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 POTEB3-201ENST00000611217 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PPT1-204ENST00000439754 2195 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 KLKP1-202ENST00000597246 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC104590.1-202ENST00000558368 1921 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC091807.1-201ENST00000418838 1544 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CCDC149-208ENST00000635206 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 OSBPL9-201ENST00000361556 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 IP6K2-201ENST00000328631 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 APOL2-203ENST00000451256 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 BCAS3-221ENST00000588874 2948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATP2C1P98194 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms