Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 USP20-201ENST00000315480 4458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 DANT2-201ENST00000430756 2079 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AL513497.1-201ENST00000624273 2083 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC005077.3-201ENST00000449614 213 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC095350.1-204ENST00000585405 616 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 MADD-203ENST00000349238 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 ZNF621-202ENST00000339296 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 NIN-206ENST00000453196 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC239798.2-201ENST00000415338 3540 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 YIPF6-201ENST00000374622 6134 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 MIRLET7BHG-201ENST00000360737 4560 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC008687.7-203ENST00000598442 551 ntTSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 MIR8071-1-201ENST00000616769 65 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 MIR8071-2-201ENST00000616772 65 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
DPM3Q9P2X0 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms