Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 EIF3A-203ENST00000541549 4495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CBR4-202ENST00000504480 1602 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GPR37L1-201ENST00000367282 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GOLGA8O-201ENST00000509311 1997 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 UGT1A5-201ENST00000373414 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FAM161A-203ENST00000405894 3684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PTGR2-205ENST00000555661 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC009108.4-201ENST00000623284 2451 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 OS9-220ENST00000552285 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 UNC13D-202ENST00000412096 3648 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AAAS-201ENST00000209873 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GAS8-220ENST00000620723 3308 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 POLA2-201ENST00000265465 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CORO7-202ENST00000537233 3392 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 C12orf66-201ENST00000311915 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SCNN1D-202ENST00000338555 3475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PSMC4-201ENST00000157812 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 OTOF-204ENST00000402415 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 EGLN3-205ENST00000547327 2849 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LGALS3BP-201ENST00000262776 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PEX5-201ENST00000266563 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ERBB2-201ENST00000269571 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 KLHL30-201ENST00000409223 3726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CACNA1C-204ENST00000347598 6655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HERC6-201ENST00000264346 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 SLC39A14-204ENST00000381237 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ZNF831-203ENST00000637017 10953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 OAZ3-203ENST00000453029 729 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 FBXL12-202ENST00000585379 956 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 DAG1-218ENST00000515359 5576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GRID2-201ENST00000282020 6117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 BCL9-201ENST00000234739 6278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ARL4A-203ENST00000396663 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 MARCH10-209ENST00000583600 3214 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
SMIM3Q9BZL3 PEX1-204ENST00000438045 3329 ntTSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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